Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms