Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms