Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms