Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms