Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms