Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms