Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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