Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nbr1P97432 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms