Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms