Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms