Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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