Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ldb1P70662 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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