Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms