Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms