Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms