Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Traf5P70191 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms