Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl18aP62717 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms