Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tdrd6P61407 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tdrd6P61407 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tdrd6P61407 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tdrd6P61407 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tdrd6P61407 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd6P61407 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tdrd6P61407 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms