Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2d1P61080 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2d1P61080 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms