Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms