Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdrg1P59048 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms