Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
P58686 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
P58686 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
P58686 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
P58686 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
P58686 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
P58686 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P58686 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P58686 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms