Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms