Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms