Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TdgP56581 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TdgP56581 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TdgP56581 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TdgP56581 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TdgP56581 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TdgP56581 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TdgP56581 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TdgP56581 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms