Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp1P56183 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms