Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efnb1P52795 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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