Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms