Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TubP50586 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TubP50586 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TubP50586 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TubP50586 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TubP50586 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TubP50586 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TubP50586 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TubP50586 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TubP50586 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TubP50586 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TubP50586 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TubP50586 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TubP50586 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TubP50586 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms