Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms