Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms