Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VdrP48281 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VdrP48281 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
VdrP48281 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VdrP48281 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VdrP48281 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VdrP48281 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VdrP48281 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VdrP48281 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms