Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Resp18P47939 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Resp18P47939 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms