Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tulp2P46686 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms