Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sipa1P46062 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms