Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VhlP40338 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
VhlP40338 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
VhlP40338 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
VhlP40338 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
VhlP40338 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms