Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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