Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms