Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pola2P33611 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pola2P33611 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pola2P33611 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms