Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms