Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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