Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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