Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VtnP29788 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
VtnP29788 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
VtnP29788 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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VtnP29788 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VtnP29788 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VtnP29788 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VtnP29788 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VtnP29788 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VtnP29788 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VtnP29788 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VtnP29788 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VtnP29788 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VtnP29788 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VtnP29788 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VtnP29788 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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