Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms