Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DcnP28654 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DcnP28654 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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DcnP28654 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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DcnP28654 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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DcnP28654 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DcnP28654 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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