Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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