Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa3P28310 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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