Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BrafP28028 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BrafP28028 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BrafP28028 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BrafP28028 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms