Protein–RNA interactions for Protein: P27808

Mgat1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat1P27808 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgat1P27808 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mgat1P27808 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mgat1P27808 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mgat1P27808 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mgat1P27808 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mgat1P27808 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgat1P27808 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms