Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms